«مرضیه دوست من» داستان یک زن بیست و چند ساله افغان است که مانند همه جوانان آرزوی عشق، آزادی و شغل را دارد. او آرزوی صلح و استقلال دارد، اما چون در افغانستان زندگی می کند، رویاهایش انقلابی است. در نهایت داستان مرضیه به نمادی از مبارزات گسترده تر زنان افغان تبدیل می شود.
این فیلم زندگی مرضیه را از بهار 2011 تا پایان سال 2014، زمانی که قرار بود نیروهای بین المللی افغانستان را ترک کنند، دنبال می کند.