معجزهی موسی داستان پسر نوجوانی به نام موسی است که پدرش را در حادثه ریزش معدن از دست میدهد.
او که از همان اول آدم خاصی است، در مکتبخانه سنتی درس نمیخواند و در طی موشدوانی در مکتبخانه اخراج میشود. از سوی دیگر، بعد از پدرش بایستی نانآور خانواده هم باشد. مادرش او را به چندین جای میبرد که کار کند و در آخر به خانه کسی به عنوان چوپان کار میکند.
موسی در جریان بازیها و مسابقاتی که با بچههای هم سن و سال خود دارد، بر سر کوهی بلند میشود که تا حالا کسی در آنجا قدم گذاشته نتوانسته است. موسی بعد از آن به آدم دیگری تبدیل میشود، انسانی که فداکار است و زورمند. شخصیتش متحول میشود.